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BIOESTAT – aplicações estatísticas nas áreas das Ciências Bio-Médicas
Abstract
BioEstat is a book and a free software for undergraduate and graduate students, researchers and teachers, with 210 statistical applications easy to use for beginners, mainly about the areas of biological and medical sciences.
The software contains the user guide (in file format "pdf") with simple and precise instructions for each test, practical examples, more frequent usage graphs, glossary linked to biometrics an statistical formulas concerning applications BioEstat.
The license to use this program is also free, the installation is permitted on multiple computers.
... Allelic and genotypic frequencies corresponding to cytokine gene promoter regions were examined for Hardy-Weinberg equilibrium and compared among the four groups using the Kruskal-Wallis test for non-parametric variables and ANOVA for parametric variables, with covariate adjustment. The analyses were performed using JASP version 0.18.3 [24] and Bioestat 5.3 [25]. Statistical significance was considered at p ≤ 0.05. ...
Viral coinfection among HIV-positive patients, coupled with the development of AIDS, remains a major public health problem. The synergism between the presence of HIV and other viruses has consequences in relation to changes in the severity of the infection, as well as changes in the natural course of both infections. Several polymorphisms present in genes that encode cytokines have a relevant influence on their transcription and consequently on the production of such immunological molecules. The present study evaluated the influence of SNPs located in the promoter regions of genes encoding the cytokines INF-ɣ, TNF, IL-6, IL-4, and IL-2, as well as their respective plasma concentrations, in patients infected with HIV and/or EBV in the state of Pará. Additionally, this study described the epidemiological profile and compared CD4+ and CD8+ T lymphocyte counts among the groups studied. The associative analysis between the SNPs and plasma cytokine concentrations in different groups showed statistical relevance for three polymorphisms: rs2069762 (IL2), where the GG genotype demonstrated higher IL-2 levels in HIV mono-infected individuals; rs2243250 (IL4), where the CT genotype showed higher IL-4 levels in the control group; and rs2069705 (IFNG), where the TT genotype showed higher IFN-γ levels in the coinfected group. Regarding SNP associations with CD4+/CD8+ counts, significant findings were observed in HIV mono-infected individuals: the rs2069705 (IFNG) polymorphism was linked to higher CD4+ counts with the CT genotype, and rs1799964 (TNF) was associated with higher CD8+ counts with the CC genotype. Therefore, this study provides evidence that the rs2069705 (IFNG) SNP is associated with elevated IFN-γ levels, which may have pathogenic consequences, as depletion of this cytokine is concerning for people living with HIV due to its antiviral properties.
... The proportions of positive cows, embryos, fetuses, and biological samples were compared through the chi-squared test with Yates' continuity correction or Fisher's exact test using BioEstat 5.3 software [28], considering a 5% significance level (p ≤ 0.05). ...
Leptospirosis is an infectious disease that affects domestic animals, wild animals, and humans. It represents a public health problem and has an important economic impact on livestock. This study aims to investigate the importance of genital and transplacental infection in the epidemiology of leptospirosis in cows maintained in Caatinga biome conditions, Northeastern Brazil, as well as reporting organs colonized by Leptospira spp. in embryos and fetuses. Blood, urinary tract (urine, bladder, and kidney), and reproductive tract (vaginal fluid, uterus, uterine tube, ovary, and placenta) samples were collected from 15 slaughtered pregnant cows. Two embryos and 13 fetuses were sampled. Central nervous system and choroid ovoid samples were collected from embryos. Blood, central nervous system, lung, peritoneal liquid, abomasal content, liver, spleen, urine, bladder, kidney, and reproductive system samples were collected from fetuses. Diagnostic methods included the microscopic agglutination test (MAT) using a collection of 24 serovars belonging to 17 different pathogenic serogroups of five species as antigens, as well as polymerase chain reaction (PCR). Anti-Leptospira spp. antibodies were found in 9 cows (60%), while 13 cows (86.67%) had at least one organ or urine with leptospiral DNA. No fetus was seroreactive. Among the embryos and fetuses, 13 (86.67%) presented leptospiral DNA, proving a high frequency of transplacental infection (100%). For cows, the most frequent biological materials regarding Leptospira spp. DNA detection were placenta (13 out of 15 samples; 86.7%), uterus (10 out of 15 samples; 66.7%), and vaginal fluid (5 out of 15 samples; 33.3%), while, for fetuses/embryos, the most frequent PCR-positive samples were choroid ovoid (1/2; 50%), spleen (6/13; 46.2%), kidney (5/13; 38.5%), and central nervous system (5/15; 33.3%). Sequenced samples based on the LipL32 gene presented 99% similarity with L. borgpetersenii. The results indicate that transplacental infection is an efficient way of spreading Leptospira spp. in cows maintained in Caatinga biome conditions. Therefore, prevention and control strategies must include actions that interrupt transmission through this alternative route.
... All the data were subjected to analysis of variance (ANOVA) and Tukey's test using BioEstat 5.0 [25]. The p values less than 0.05 were considered significant. ...
The slow action of fungi is one of the biggest challenges in using entomopathogenic fungi. A promising alternative to reduce the time of action is to combine conidia with extracellular enzymes. This study aimed to characterize the production of Pr1 subtilisin protease and lipases by Beauveria bassiana and Metarhizium anisopliae in different culture media and to evaluate the efficiency of the enzymatic treatment against Aphis gossypii and Spodoptera frugiperda. The isolates were cultivated in five different liquid cultures, and, after 7 days, the culture was filtered and centrifuged, and the activity of the Pr1 and lipases was measured. The fungi cultured in a Luria-Bertani broth medium had the highest activity of proteases and lipases. The mortality of A. gossypii nymphs treated with conidia 7 days after the treatment was 39% (JEF-410), 76.5% (JEF-492), 74.8% (ERL-836), and 70.9% (JEF-214). The B. bassiana JEF-410 supernatant combined with conidia increased the fungal virulence at day 5 and day 6 after treatment. When S. frugiperda larvae were treated with B. bassiana JEF-492 conidia combined with its supernatant, the time of infection was shorter compared to the larvae treated with conidia only. Once the supernatant was incubated at 37 • C, the relative activity decreased from 100% to 80% after 2 h and to 45% after 24 h. The results suggest that the supernatant of entomopathogenic fungi may be formulated and used as a biopesticide in an efficient strategy for the biological control of pests.
... De novembro de 2018 a junho de 2019, os três grupos de saguis (3, 4 e 5) foram observados por 85 h 32 min (35 h 44 min -Grupo 3; 28 h 03 min -Grupo 4; 21 h 58 min -Grupo 5). (Ayres et al., 2007). ...
Nosso objetivo do estudo foi caracterizar a área de vida, a composição de grupos e a dieta de saguis em um pequeno trecho de mata ciliar (21ha) em uma área urbana, o Parque Linear do Ribeirão das Pedras (Barão Geraldo, Campinas-SP) no sudeste do Brasil. Seguimos cinco grupos entre janeiro de 2018 a junho de 2019, em um total de 15 saguis, sendo híbridos e morfotipos de Callithrix jacchus e C. penicillata. As áreas de vida desses saguis, variando entre 0.2 e 14.4 ha, foram distribuídas ao longo da faixa florestal. A dieta dos saguis apresentou inovações, em comparação à dieta dos saguis na distribuição geográfica original. Os alimentos mais consumidos foram a goma e a banana. Durante todo o período, a goma foi o principal item consumido pelos saguis. A espécie exótica da árvore gomífera Terminalia catappa foi uma espécie-chave na alimentação dos saguis na estação seca. Apesar de enfrentarem os desafios do ambiente urbano, os saguis obtêm alimentos e se reproduzem, se estabelecendo na região e, provavelmente, aumentando a população num futuro próximo. Sugerimos um monitoramento dessas populações e o desenvolvimento de medidas de educação ambiental. Além disso, novos estudos podem ser importantes para melhor compreensão das dinâmicas desempenhadas pelos saguis no meio urbano.
O uso de LEDs, como fonte de radiação no cultivo de plantas, tem despertado considerável interesse nos últimos anos, por estes também possuírem vasto potencial para a aplicação comercial. Aeollanthus suaveolens é uma planta medicinal popularmente conhecida como Catinga-de-mulata utilizada pela população para dores em gerais. A micropropagação em plantas medicinais é uma alternativa para propagação comercial dessas espécies que apresentam interesse econômico. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de diferentes comprimentos de luz LED sobre o desenvolvimento in vitro da espécie Catinga-de-mulata. O estudo, conduzido no Laboratório de Biotecnologia e Recursos Genéticos da Embrapa Amazônia Oriental, utilizou explantes de plantas micropropagadas in vitro. Os explantes (segmento nodal), medindo aproximadamente 1 cm, foram inoculados em frascos de 250 mL contendo 30 mL de meio MS (Murashige e Skoog, 1962). Os meios foram suplementados com sacarose (30,0 g.L-1), o pH foi ajustado a 5,7 ± 0,1 e em seguida gelificados com ‘Phytagel’ (3,0 g.L-1). Após a inoculação, os frascos foram acondicionados em uma sala com temperatura de 25 ± 1°C em 4 diferentes comprimentos de onda: LED branca: 26 μmol.m-2.s-1, LED verde: 15 μmol.m-2.s-1, LED azul: 23 μmol.m-2.s-1, LED amarelo: 13 μmol.m-2.s-1. O fotoperíodo foi de 12 horas/dia. Durante 120 dias, as alturas das plântulas e o número de brotos foram mensalmente avaliados. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado (DIC). A diferença das amostras foi calculada com a utilização do software BioEstat versão 5.3. Na avaliação de 30 e 60 dias ocorreu diferença estatística se destacando branco e azul, para 90 dias apenas o tratamento verde ainda mantém um desenvolvimento abaixo dos demais, mas para 120 dias prevalecem os tratamentos branco e azul com médias 6,78 cm e 6,42 cm. Quanto ao número de brotos o tratamento azul prevalece estatisticamente em 120 dias com média 5,13 brotos. Para os teores de clorofila e carotenoides os diferentes comprimentos de onda influenciam nesses parâmetros. Conclui-se que os tratamentos branco e azul tiveram os melhores resultados nas variáveis altura, brotação, clorofila e carotenoides.
Foi investigado a atividade antimicrobiana de extratos metabólicos fúngicos presentes em espécies de microfungos da Micoteca (Coleção de Fungos) do Laboratório de Biologia dos Fungos do Campus X da Universidade do Estado da Bahia. O processo consistiu em reativar os microfungos já coletados e isolados, extraindo os metabólitos secundários dos fungos reativados e testando-os contra os seguintes microrganismos patogênicos: Escherichia coli; Staphylococcus aureus; Klebsiella pneumoniae; Pseudomonas aeruginosa e Candida albicans. O processo consistiu na reativação de 32 diferentes microfungos (Acremonium spp.; Alphanocladium spp.; Aspergillus calidoustus; Aspergillus flavus; Aspergillus japonicus; Cladosporium spp. Cladosporium sp. 01; Colletotrichum bannaense; Colletotrichum sp. 01; Colletotrichum sp. 03; Curvularia brachyospora; Exophiala spp.; Fusarium graminearum; Fusarium redolens; Fusarium sp. 01; Fusarium sp. 03a; Fusarium sp. 03b; Mucor spp.; Nigrospora gorlenkoana; Nigrospora rubi; Nigrospora sphaerica; Penicillium chrysogenum; Penicillium citrinum; Penicillium simplicissimum; Penicillium sp. 01; Penicillium sp. 02a; Penicillium sp. 02b; Pestalotiopsis spp.; Talaromyces sp. 03; Thozetella sp. 01; Thozetella sp. 03 e Thozetella sp. 06). A reativação desses microfungos ocorreu em Ágar Batata Dextrose (ABD) colocados em estufa B.O.D. a 28°C/7 dias. Após esse período foram colocados em Caldo Batata Dextrose (CBD) em B.O.D. a 28°C/15 dias. A partir do filtrado do CBD, foi feito o Teste de Sensibilidade ao Antimicrobiano (TSA). Aspergillus calidoustus, Colletotrichum sp. 01, Curvularia brachyospora e Thozetella sp. 06, apresentaram atividade antimicrobiana contra os cinco microrganismos testados. O grupo do gênero onde todos os microfungos inibiram S. aureus foram Aspergillus e os gêneros que inibiram K. pneumoniae foram Nigrospora e Penicillium. Não houve diferença significativa (p=0,0756) entre o tamanho médio dos halos de inibição contra os diferentes microrganismos testados, porém, houve diferença significativa (p=0,0029) entre os diferentes extratos metabólitos fúngicos secundários testados. Com isso, a extração de metabolitos secundários fúngicos apresenta-se como um potencial de descoberta de novos compostos bioativos contra microrganismos patogênicos multirresistentes.
O uso de LEDs, como fonte de radiação no cultivo de plantas, tem despertado considerável interesse nos últimos anos, por estes também possuírem vasto potencial para a aplicação comercial. A espécie Conobea scoparioides (Pataqueira) sendo nativa da Amazônia brasileira, tendo uso reportado como purgante, acaricida, antifúngico, antimalárico, antitérmico e leishmanicida. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de diferentes comprimentos de luz LED sobre o desenvolvimento in vitro da espécie Pataqueira. O estudo, conduzido no Laboratório de Biotecnologia e Recursos Genéticos da Embrapa Amazônia Oriental, utilizou explantes de plantas micropropagadas in vitro. Os explantes (segmento nodal) da pataqueira, medindo aproximadamente 1 cm, foram inoculados em frascos de 250 mL contendo 30 mL de meio MS (Murashige e Skoog, 1962). Os meios foram suplementados com sacarose (30,0 g.L-1), o pH foi ajustado a 5,7 ± 0,1 e em seguida gelificados com ‘Phytagel’ (3,0 g.L-1). Após a inoculação, os frascos foram acondicionados em uma sala com temperatura de 25 ± 1°C em 4 diferentes comprimentos de onda: LED branca: tratamento 1: 26 μmol.m-2.s-1, LED verde: tratamento 2: 15 μmol.m-2.s-1, LED azul: tratamento 3: 23 μmol.m-2.s-1, LED amarelo: tratamento 4: 13 μmol.m-2.s-1. O fotoperíodo foi de 12 horas/dia. Durante 120 dias, as alturas das plântulas e o número de brotos foram mensalmente avaliados. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado (DIC). A diferença das amostras foi calculada com a utilização do software BioEstat versão 5.3. Na avaliação de 30 e 60 dias, não houve diferença estatística na altura média das plântulas entre os tratamentos, para 90 dias o tratamento branco tem melhor resultado média 5,13 cm, para 120 dias os tratamentos verde e amarelo possuem melhor desempenho. Quanto ao número médio de brotos, houve diferença estatística significativa se destacando os tratamentos verde e amarelo. Para os teores de clorofila e carotenoides os diferentes comprimentos de onda influenciam nesses parâmetros. Conclui-se que os tratamentos verde e amarelo tiveram os melhores resultados nas variáveis altura, brotação, clorofila e carotenoides.
Habitat for organisms in ecosystems include attributes to the ecological significance and resulting from the interactions between its physical, chemical and biological components. In fishponds, one of the important features is the community of the microzooplankton that é key component of marine food webs and food chain in freshwater. An experiment was carried out in an area for fish farming, located in Assis Brasil Village, municipality of Cruzeiro do Sul, State of Acre, aimed to observe the dynamics of fish farming tanks, and the composition and microzooplankton abundance, submitted to two treatments, commercial feed (ad libitum) and tabulated feed. The results showed that environments severely eutrophicated are characterized by high values of phosphorus and nitrogen, and dominance of species of Rotifera, throughout the study. On this basis, it was concluded that researches of this nature contributes for determining the water quality, particularly using potential bioindicator species, that grow excessively in these environments.
A Aeollanthus suaveolens conhecida popularmente como catinga-de-mulata é uma espécie de origem africana, presente em diversas regiões do Brasil, inclusive na região amazônica. Seu principal uso medicinal é seu efeito sedativo e anticonvulsionante, sendo também usada como materia prima de perfumes caseiros. A micropropagação é uma técnica que pode ampliar o conhecimento ou proteger, através da conservação in vitro, espécies com potencial uso presente ou futuro. O objetivo do presente trabalho foi desenvolver um protocolo de conservação in vitro para A. suaveolens visando o crescimento lento. Os explantes foram inoculados em meio MS em duas salas distintas. Sala 1: temperatura de 18 ± 1°C, três diferentes irradiâncias de luz LED branca: 35, 45 e 75 μmol.m-2.s-1. Sala 2: temperatura de 25 ± 1°C, irradiância de luz fluorescente branca fria: 25 μmol.m-2.s-1. Na temperatura de 18 ± 1°C, as taxas de sobrevivência foram variadas, sendo que houveram perdas em todos os tratamentos devido a contaminação. Na temperatura de 25 ± 1°C, o tratamento de 25 μmol.m-2.s-1 obteve porcentagem de sobrevivência de 100% até o 6º mês (180 dias). Na avaliação da altura, na primeira avaliação, nos tratamentos de 35, 45 e 75 μmol.m-2.s-1, a 18 ± 1ºC, a altura média das plântulas foi de 1,67; 1,07 e 0,53 cm, respectivamente. Não houve diferença estatística significativa entre os tratamentos. Nas avaliações seguintes, a altura média do tratamento de 75 μmol.m-2.s-1 difere estatisticamente entre os tratamentos de 35 e 45 μmol.m-2.s-1, sendo que essa diferença permanece até o 9º mês (270 dias), onde ocorre o descarte por senescência. No tratamento de 25 μmol.m-2.s-1, a 25 ± 1°C, em todas as avaliações, a altura média das plântulas foram acima dos tratamentos da sala a 18 ± 1°C. Em relação ao número de brotações, em todas as avaliações, os tratamentos de 35, 45 e 75 μmol.m-2.s-1 não apresentaram diferença estatística significativa. Conclui-se que o fator temperatura foi determinante para a redução do crescimento in vitro da A. suaveolens, sendo uma estratégia eficaz para aumentar o intervalo de subcultivo.
A Aeollanthus suaveolens conhecida popularmente como catinga-de-mulata é uma espécie de origem africana, presente em diversas regiões do Brasil, inclusive na região amazônica. Seu principal uso medicinal é seu efeito sedativo e anticonvulsionante, sendo também usada como materia prima de perfumes caseiros. A micropropagação é uma técnica que pode ampliar o conhecimento ou proteger, através da conservação in vitro, espécies com potencial uso presente ou futuro. O objetivo do presente trabalho foi desenvolver um protocolo de conservação in vitro para A. suaveolens visando o crescimento lento. Os explantes foram inoculados em meio MS em duas salas distintas. Sala 1: temperatura de 18 ± 1°C, três diferentes irradiâncias de luz LED branca: 35, 45 e 75 μmol.m-2.s-1. Sala 2: temperatura de 25 ± 1°C, irradiância de luz fluorescente branca fria: 25 μmol.m-2.s-1. Na temperatura de 18 ± 1°C, as taxas de sobrevivência foram variadas, sendo que houveram perdas em todos os tratamentos devido a contaminação. Na temperatura de 25 ± 1°C, o tratamento de 25 μmol.m-2.s-1 obteve porcentagem de sobrevivência de 100% até o 6º mês (180 dias). Na avaliação da altura, na primeira avaliação, nos tratamentos de 35, 45 e 75 μmol.m-2.s-1, a 18 ± 1ºC, a altura média das plântulas foi de 1,67; 1,07 e 0,53 cm, respectivamente. Não houve diferença estatística significativa entre os tratamentos. Nas avaliações seguintes, a altura média do tratamento de 75 μmol.m-2.s-1 difere estatisticamente entre os tratamentos de 35 e 45 μmol.m-2.s-1, sendo que essa diferença permanece até o 9º mês (270 dias), onde ocorre o descarte por senescência. No tratamento de 25 μmol.m-2.s-1, a 25 ± 1°C, em todas as avaliações, a altura média das plântulas foram acima dos tratamentos da sala a 18 ± 1°C. Em relação ao número de brotações, em todas as avaliações, os tratamentos de 35, 45 e 75 μmol.m-2.s-1 não apresentaram diferença estatística significativa. Conclui-se que o fator temperatura foi determinante para a redução do crescimento in vitro da A. suaveolens, sendo uma estratégia eficaz para aumentar o intervalo de subcultivo.
